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学科主题物理化学
Chiral elasticity of DNA
Shen, Hujun1,2; Hricko, Patrick J.2; Colina, Coray M.2; Milner, Scott T.3; ScottTMilner
刊名SOFT MATTER
2012
DOI10.1039/c2sm26123e
8期:39页:10090-10094
收录类别SCI
文章类型Article
部门归属11
项目归属1106
产权排名1,1
WOS标题词Science & Technology ; Physical Sciences ; Technology
类目[WOS]Chemistry, Physical ; Materials Science, Multidisciplinary ; Physics, Multidisciplinary ; Polymer Science
研究领域[WOS]Chemistry ; Materials Science ; Physics ; Polymer Science
关键词[WOS]NUCLEIC-ACIDS ; ENTROPIC ELASTICITY ; MOLECULAR-DYNAMICS ; NUCLEOSOMAL DNA ; IN-VITRO ; FLEXIBILITY ; SIMULATIONS ; MECHANICS ; ENERGIES ; TENSION
英文摘要DNA is a chiral semiflexible polymer, so its bending Hamiltonian may contain nonlinear terms coupling the curvature kappa to the torsion tau, leading to an average torsion independent of curvature, with variance scaling as 1/kappa(2). We perform atomistic MD simulations of 31 base-pair DNA sequences with explicit solvent, in which thermal fluctuations cause the DNA to bend. We extract bending moduli by fitting to bending and torsional angle distributions. We find that chiral elasticity matters whenever DNA bends on a radius less than about 5 nm.
语种英语
WOS记录号WOS:000308882800017
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文献类型期刊论文
条目标识符http://cas-ir.dicp.ac.cn/handle/321008/118027
专题中国科学院大连化学物理研究所
通讯作者ScottTMilner
作者单位1.Dalian Inst Chem Phys, Lab Mol Modeling & Design, Dalian 116023, Peoples R China
2.Penn State Univ, Dept Mat Sci & Engn, University Pk, PA 16802 USA
3.Penn State Univ, Dept Chem Engn, University Pk, PA 16802 USA
推荐引用方式
GB/T 7714
Shen, Hujun,Hricko, Patrick J.,Colina, Coray M.,et al. Chiral elasticity of DNA[J]. SOFT MATTER,2012,8(39):10090-10094.
APA Shen, Hujun,Hricko, Patrick J.,Colina, Coray M.,Milner, Scott T.,&ScottTMilner.(2012).Chiral elasticity of DNA.SOFT MATTER,8(39),10090-10094.
MLA Shen, Hujun,et al."Chiral elasticity of DNA".SOFT MATTER 8.39(2012):10090-10094.
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